Estimativa da diversidade genética e análise da estrutura de populações de espécies de Conyza

Marochio, Carlos Alexandre

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Campo DC	Valor	Idioma
dc.contributor.advisor	Maria de Fátima Pires da Silva Machado	pt_BR
dc.contributor.author	Marochio, Carlos Alexandre	pt_BR
dc.date.accessioned	2018-04-04T17:23:07Z	-
dc.date.available	2018-04-04T17:23:07Z	-
dc.date.issued	2014	pt_BR
dc.identifier.uri	http://repositorio.uem.br:8080/jspui/handle/1/1140	-
dc.description.abstract	The purpose of this study was to investigate the genetic variability at the molecular level, and check how they are genetically structured species Conyza canadensis, C. bonariensis and C. sumatrensis, analyzing polymorphism loci in simple sequence repeat (SSR loci) of DNA, also called microsatellite loci. Samples of C. canadensis were analyzed, sensitive and resistant to glyphosate, and C. bonariensis resistant and dual resistance, collected in the Central Valley of Califomia (USA), and samples of C. sumatrensis sensitive and resistant collected in six counties of the State of Parana (Brazil), using the HWO2, HW06, HW07, HW09, HWI4, HW29, HWSSROl, HWSSRO3, HWSSRO4, HWSSRO7, HWSSRO9 and HWSSRll primers to analyze the polymorphism in 12 loci microsatellites. The large number of alleles (26) was found in C. sumatrensis. The largest proportion of polymorphic microsatellite loci (9l.67%) was observed in the plants of the species C. bonariensis, but the number of alleles per locus (Na = 2.l667), effective number of alleles (Ne = l.9388), and mean expected heterozygosity (He - ().429l) was also higher in samples of C. sumatrensis, indicating that the genetic diversity in the species is longer C. sumatrensis. Samples of C. canadensis showed the lowest genetic diversity. The genetic divergence between the three species of Conyza was high (FST = 0.25), indicating that these populations are genetically structured. The HW07, HWI4, HW29, HWSSR0l, HWSSR03, HWSSR04, HWSSRO7, HWSSRO9 and HWSSRll primers were shown to differentiate the three species of Conyza. The proportion of polymorphic microsatellite loci was higher in the samples of C. canadensis resistant (R), but the effective number of alleles and the values of Ho and He, were equivalent in sensitive genotypes (S) and resistant, indicating that C. canadensis-S and C. canadensis-R has the same potential to colonize new areas. The values of Ho and He were also similar among the genotypes of C. sumatrensis-S and C. sumatrensis-R. Samples of C. sumatrensis formed genetically structured populations (FST = 0.4822). In the municipalities of Campo Mourão and Cafelândia copies of Conyza features at the molecular level, for microsatellite loci C. canadensis, C. bonariensis and C. surnatrensis, and copies that share alleles characteristic of the species, indicating the occurrence of the three species, suggesting that there is an exchange of alleles between the three Conyza species in that region.	en
dc.language	por	pt_BR
dc.publisher	Universidade Estadual de Maringá	pt_BR
dc.rights	openAccess	pt_BR
dc.subject	Plantas daninhas	pt_BR
dc.subject	Buva	pt_BR
dc.subject	Conyza ssp.	pt_BR
dc.subject	Resistência	pt_BR
dc.subject	Herbicida glyphosate	pt_BR
dc.subject	Marcadores moleculares	pt_BR
dc.subject	Microssatélites	pt_BR
dc.subject	Brasil.	pt_BR
dc.subject	Weeds	en
dc.subject	Buva	en
dc.subject	Conyza ssp .	en
dc.subject	Resistance	en
dc.subject	Herbicide glyphosate	en
dc.subject	Molecular markers	en
dc.subject	Microsatellites	en
dc.subject	Brazil.	en
dc.title	Estimativa da diversidade genética e análise da estrutura de populações de espécies de Conyza	pt_BR
dc.type	doctoralThesis	pt_BR
dc.contributor.referee1	Rubem Silvério de Oliveira Júnior - UEM	-
dc.contributor.referee2	Fernando Storniolo Adegas - EMBRAPA	-
dc.contributor.referee3	Jamil Constantin - UEM	-
dc.contributor.referee4	Claudete Aparecida Mangolin - UEM	-
dc.description.resumo	A proposta no presente estudo foi investigar a variabilidade genética em nível molecular, e Verificar a forma como estão geneticamente estruturadas as espécies de Conyza canadensis, C. bonariensis, e C. sumatrensis, analisando o polimorfismo em locos de seqüência simples repetidas (locos SSR) de DNA, também denominados locos de microssatélite. Foram analisadas amostras de C. canadensis, sensíveis e resistentes ao glifosato, e C. bonariensis resistentes e com resistência múltipla, coletadas no Vale Central da Califomia (USA), e amostras de C. sumatrensis sensíveis e resistentes, coletadas em seis municípios do Estado do Paraná (Brasil), usando os primers HW02, HW06, HW07, HW09, HWI4, HW29, HWSSR0l, HWSSR03, HWSSR04, HWSSR07, HWSSRO9 e HWSSRll para analisar o polimorfismo nos l2 locos microssatélite. O maior numero de alelos (26) foi encontrado em C. surnatrensis. A maior proporção de locos mierossatélites polimórficos (9l,67%) foi observada nas plantas da espécie C. bonariensis, mas o numero de alelos por locos (Na = 2,l667), numero efetivo de alelos (Ne = l,9388), e heterozigosidade media esperada (He A O,429l), também foi maior nas amostras de C. sumatrensis, indicando que a diversidade genética é maior na espécie C. sumatrensis. As amostras de C. canadensis apresentaram a menor diversidade genética. A divergência genética entre as três espécies de Conyza foi alta (FST = O,25), indicando que estas sao populaeoes geneticamente estruturadas. Os primers HW07, HWl4, HW29, HWSSROI, HWSSRO3, HWSSRO4, HWSSRO7, HWSSRO9 e HWSSRll foram indicados para diferenciar as tres espécies de Conyza. A proporeao de locos microssatelites polimorllcos foi maior nas amostras de C. canadensis resistentes (R), mas o numero efetivo de alelos e os Valores de Ho e He foram equivalentes nos genótipos sensíveis (S) e resistentes, indicando que C. canadensis-S e C. canadensis-R tem o mesmo potencial para colonizar novas áreas. Os Valores de Ho e He também foram equivalentes nos genótipos de C. sumatrensis-S e C. surnatrensis-R. As amostras de C. sumalrensis formaram populações geneticamente estruturadas (FST = 0,4822). Nos municípios de Campo Mourão e Cafelândia ha exemplares de Conyza com características em nivel molecular, para locos mierossatélites, de C. canadensis, C. bonariensis, e C. sumatrensis, e exemplares que compartilham alelos característicos das espécies, indicando a ocorrência das três espécies e sugerindo que há troca de alelos entre as três espécies de Conyza na referida região.	pt_BR
dc.publisher.country	Brasil	pt_BR
dc.publisher.department	Departamento de Agronomia	-
dc.publisher.program	Programa de Pós-Graduação em Agronomia	pt_BR
dc.publisher.initials	UEM	pt_BR
dc.subject.cnpq1	Ciências Agrárias	pt_BR
dc.publisher.local	Maringá, PR	pt_BR
dc.description.physical	x, 56 f	pt_BR
dc.subject.cnpq2	Agronomia	pt_BR
dc.publisher.center	Centro de Ciências Agrárias	pt_BR
Aparece nas coleções:	3.1 Tese - Ciências Agrárias (CCA)

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