Análise proteômica comparativa de gemas axilares ativas e dormentes da cultivar RB867515 de cana de açúcar

Abstract

RESUMO: A cana-de-açúcar é a matéria prima que move o setor sucroenergético. Dela é obtido como principais produtos o açúcar e o etanol, além da cogeração de energia a partir do bagaço que supre a demanda do setor,sendo seus subprodutos utilizados na cogeração de energia e em diversos processos industriais. O estabelecimento de um canavial é dependente da brotação de gemas axilares. O presente estudo teve como objetivo catalogar o proteoma total de gemas axilares germinativas e inativas/dormentes, e identificar proteínas importantes na brotação, que são diferencialmente expressas nesses tipos de gemas axilares. O proteoma foi obtido pela extração de proteínas totais utilizando o método TCA/acetona adaptado para gemas axilares. A identificação das proteínas foi realizada pelo sistema UPLC-ESI-Q-TOF e Mascot. O experimento foi realizado em triplicata. Um total de 159 proteínas e polipeptídeos foram identificadas, destas, 72 foram detectadas em ambos os tipos de gemas axilares, 46 e 41 foram diferentemente expressas nas gemas axilares germinativas e dormentes, respectivamente. As proteínas identificadas atuam como componentes celulares e em diversos processos biológicos como metabolismo de carboidratos, lipídeos e ácidos nucleicos, resposta a estresses, entre outros

ABESTRACT: Sugarcane is the raw material that moves the sugarcane industry. Sugarcane is obtained as the main products, sugar and ethanol, as well as energy cogeneration from the bagasse that supplies the sector's demand, and its by-products are used in energy cogeneration and in various industrial processes. The establishment of a cane field is dependent on the budding of axillary buds. The present study aimed to catalog the total proteome of germinative and inactive / dormant axillary buds, and to identify important budding proteins, which are differentially expressed in these types of axillary buds. The proteome was obtained by extraction of total proteins using the TCA / acetone method adapted for axillary buds. Protein identification was performed by the UPLC-ESI-Q-TOF and Mascot system. The experiment was carried out in triplicate. A total of 159 proteins and polypeptides were identified. Of these, 72 were detected in both types of axillary buds, 46 and 41 were differentially expressed in germinative and dormant axillary buds, respectively. The proteins identified act as cellular components and in several biological processes such as metabolism of carbohydrates, lipids and nucleic acids, response to stress, among others